Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 AP001160.4-201ENST00000596971 382 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
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USP35Q9P2H5 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
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USP35Q9P2H5 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
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USP35Q9P2H5 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
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