Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
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CNTN3Q9P232 CSDE1-205ENST00000438362 4167 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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CNTN3Q9P232 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CNTN3Q9P232 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CNTN3Q9P232 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CNTN3Q9P232 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CNTN3Q9P232 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CNTN3Q9P232 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CNTN3Q9P232 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CNTN3Q9P232 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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