Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 IL2RA-203ENST00000379959 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 GJB6-205ENST00000636852 1840 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 AL031651.1-201ENST00000615357 1438 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 YES1-203ENST00000577961 4554 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 TTC26-203ENST00000464848 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 SPEF2-202ENST00000356031 5681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 RASSF9-201ENST00000361228 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 MEF2C-AS1-214ENST00000514794 2350 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 ADA2-210ENST00000610390 4137 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 CENPJ-206ENST00000616936 5020 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 NXF2B-203ENST00000604395 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 NXF2-201ENST00000604790 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 SRSF11-202ENST00000370950 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 IL1RL1-202ENST00000311734 3994 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 FLRT3-201ENST00000341420 3971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 AP003789.1-201ENST00000617737 605 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 GOLGA6L22-204ENST00000622895 4178 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 DNA2-208ENST00000551118 3468 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 VTCN1-202ENST00000359008 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133 ms