Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 ZNF438-201ENST00000331737 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 ARPP21-201ENST00000187397 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 PSMB2-202ENST00000621781 4217 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 AP002370.1-201ENST00000528055 1602 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 WBP11P1-201ENST00000562560 1931 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 OR52B5P-204ENST00000641744 3467 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 TRIM6-205ENST00000445329 2951 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 AL357568.1-201ENST00000421530 1963 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 SEMA5A-AS1-201ENST00000510879 1679 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 AC217777.1-201ENST00000570034 1471 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 AC245036.1-201ENST00000391727 309 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 AL353148.1-202ENST00000424701 551 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 AL669831.5-205ENST00000429505 441 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 AC064862.5-201ENST00000440618 334 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 HMGB1P7-201ENST00000450921 612 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 AF235103.1-201ENST00000530223 439 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 AC007207.2-201ENST00000543206 542 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 PPFIA2-219ENST00000550359 3808 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 CAPN3-210ENST00000561817 915 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 LINC01916-201ENST00000582028 559 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 MIR212-201ENST00000586026 110 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 AC019257.2-201ENST00000605539 497 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 TMC1-201ENST00000297784 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 LRRFIP2-201ENST00000336686 3208 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 AC022905.1-201ENST00000503430 3048 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 PIGN-207ENST00000586566 3891 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 ELMO2-203ENST00000372176 3678 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 KRT39-201ENST00000355612 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 LMO3-235ENST00000616247 3227 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 ZNF532-222ENST00000591083 5324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 MEF2C-225ENST00000625585 3467 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC7□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC7□□□□□ -1.29
NCOA4Q13772 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms