Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 OR7A8P-201ENST00000595427 913 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 AC013549.2-201ENST00000526953 489 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 DNAJA1P1-201ENST00000425106 1187 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 AL583785.1-201ENST00000428006 512 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 HPRT1P2-201ENST00000505250 544 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 LINC02422-201ENST00000535163 852 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 LINC01013-205ENST00000458028 1345 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
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