Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
DNASE1L3Q13609 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms