Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AL031846.1-202ENST00000424436 592 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 LINC00575-201ENST00000426551 910 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC018804.1-201ENST00000430381 618 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC096677.2-201ENST00000430471 598 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC007383.1-201ENST00000445875 636 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 RPS26P11-201ENST00000463445 348 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 RPL23P10-201ENST00000468780 412 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 RPS26P6-201ENST00000475156 348 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 RPL19P11-201ENST00000495944 589 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC103876.1-202ENST00000561498 369 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 ZNF841-203ENST00000594295 3819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 SSX2B-202ENST00000596480 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AL513478.2-201ENST00000610400 988 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC025162.2-201ENST00000619602 560 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 MAP4K4-221ENST00000634702 3800 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 ZNF559-ZNF177-202ENST00000446085 2470 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 NCKAP5-203ENST00000405974 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 CEP85-201ENST00000252992 3935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 ENPP5-202ENST00000371383 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 CD163-202ENST00000396620 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 ZNF214-201ENST00000278314 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 SOD2-211ENST00000538183 14266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC102941.1-201ENST00000567616 1537 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 IBTK-201ENST00000306270 6054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 CDH18-207ENST00000507958 3542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 TP53BP1-202ENST00000382039 6015 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 RGS22-215ENST00000523437 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 POF1B-202ENST00000373145 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 TRIM55-202ENST00000315962 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
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CLN3Q13286 SORBS2-221ENST00000437304 3381 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 CYSLTR2-202ENST00000614739 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 PROX1-AS1-202ENST00000433082 5266 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 BCL2L14-203ENST00000308721 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 ABCA9-201ENST00000340001 6514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 CD163-203ENST00000432237 3701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 TDRKH-201ENST00000368822 3093 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 UMAD1-206ENST00000636849 2157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 BVES-AS1-202ENST00000369122 1716 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 ARGFX-201ENST00000334384 992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 RNA5SP85-201ENST00000365378 119 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AL359715.1-201ENST00000404330 555 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AL389925.1-201ENST00000432257 728 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 LAPTM4BP1-201ENST00000447781 690 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
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