Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 LMO7-205ENST00000377534 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 ERAP2-201ENST00000379904 3219 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 GRAMD2B-212ENST00000513040 2196 ntTSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 EPHA4-201ENST00000281821 6346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 MMP10-201ENST00000279441 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 ZNF639-201ENST00000326361 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 REG4-203ENST00000369401 2327 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 LIPG-201ENST00000261292 10441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 THRB-202ENST00000356447 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 DCX-206ENST00000496551 1320 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 MBL2-201ENST00000373968 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 COL21A1-212ENST00000535941 3369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 INTS7-203ENST00000366994 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 GABRA2-215ENST00000540012 2588 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 RPL7-201ENST00000352983 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 MIR99A-201ENST00000384906 81 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AL391419.1-201ENST00000398901 1275 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC8.6□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AC005040.1-201ENST00000437783 482 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AC005550.2-201ENST00000476382 318 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 RNA5SP518-201ENST00000515957 119 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC8.6□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 IGKV2-29-201ENST00000521304 372 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC8.6□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AC016152.1-201ENST00000548344 521 ntTSL 3 BASIC8.6□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AC103740.1-202ENST00000558404 542 ntTSL 4 BASIC8.6□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 IGHV1OR15-3-201ENST00000564926 351 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 LAMTOR5-207ENST00000602858 553 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 TDGF1P3-202ENST00000602699 2710 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 TBX5-202ENST00000349716 3585 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 RASGRP3-202ENST00000403687 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 ACTG2-203ENST00000409731 1413 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 YES1-203ENST00000577961 4554 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 HKR1-203ENST00000541583 2758 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 CTAGE3P-201ENST00000454280 2404 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AC135178.2-201ENST00000582471 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 EPB41-201ENST00000343067 5956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 GPR89A-203ENST00000462900 1527 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 SLC7A6-209ENST00000566454 6308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 SIPA1L1-203ENST00000537413 4129 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 CRNKL1-207ENST00000536226 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 MMS22L-201ENST00000275053 8643 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 RN7SKP261-201ENST00000410948 278 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 RPL3P11-201ENST00000434028 1146 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AC003989.1-201ENST00000434569 565 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AL354714.5-201ENST00000450131 590 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AC090607.2-201ENST00000560331 695 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AL359091.2-201ENST00000609303 556 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 CR392039.3-201ENST00000623236 227 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 ACO1-201ENST00000309951 7466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 TNFAIP8-204ENST00000503646 2502 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AC016251.1-201ENST00000624299 4198 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 ARHGAP20-203ENST00000527598 5998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AL136146.1-201ENST00000529830 1667 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 HLTF-203ENST00000465259 5306 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 TRIM51HP-202ENST00000530412 1823 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 STAG1-202ENST00000383202 6055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 ZNF33A-204ENST00000458705 6084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 CPM-202ENST00000546373 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 B3GNT2-202ENST00000405767 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AC006019.2-201ENST00000451116 3044 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 LINC01091-204ENST00000515769 2204 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
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