Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC011492.1-201ENST00000600023 315 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
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FOXD4Q12950 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
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FOXD4Q12950 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
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