Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E1

WASHC2C, WASH complex subunit 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2CQ9Y4E1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
WASHC2CQ9Y4E1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
WASHC2CQ9Y4E1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
WASHC2CQ9Y4E1 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
WASHC2CQ9Y4E1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
WASHC2CQ9Y4E1 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
WASHC2CQ9Y4E1 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
WASHC2CQ9Y4E1 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
WASHC2CQ9Y4E1 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
WASHC2CQ9Y4E1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
WASHC2CQ9Y4E1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
WASHC2CQ9Y4E1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
WASHC2CQ9Y4E1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
WASHC2CQ9Y4E1 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
WASHC2CQ9Y4E1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
WASHC2CQ9Y4E1 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
WASHC2CQ9Y4E1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
WASHC2CQ9Y4E1 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
WASHC2CQ9Y4E1 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
WASHC2CQ9Y4E1 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
WASHC2CQ9Y4E1 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
WASHC2CQ9Y4E1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
WASHC2CQ9Y4E1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
WASHC2CQ9Y4E1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
WASHC2CQ9Y4E1 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
WASHC2CQ9Y4E1 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
WASHC2CQ9Y4E1 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
WASHC2CQ9Y4E1 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
WASHC2CQ9Y4E1 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
WASHC2CQ9Y4E1 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
WASHC2CQ9Y4E1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
WASHC2CQ9Y4E1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
WASHC2CQ9Y4E1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
WASHC2CQ9Y4E1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
WASHC2CQ9Y4E1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
WASHC2CQ9Y4E1 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
WASHC2CQ9Y4E1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
WASHC2CQ9Y4E1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
WASHC2CQ9Y4E1 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
WASHC2CQ9Y4E1 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
WASHC2CQ9Y4E1 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
WASHC2CQ9Y4E1 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
WASHC2CQ9Y4E1 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
WASHC2CQ9Y4E1 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
WASHC2CQ9Y4E1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
WASHC2CQ9Y4E1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
WASHC2CQ9Y4E1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
WASHC2CQ9Y4E1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
WASHC2CQ9Y4E1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
WASHC2CQ9Y4E1 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
WASHC2CQ9Y4E1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
WASHC2CQ9Y4E1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms