Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A8

NFE2L3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3Q9Y4A8 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFE2L3Q9Y4A8 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms