Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms