Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
UTP11Q9Y3A2 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UTP11Q9Y3A2 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms