Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms