Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB23Q9ULC3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB23Q9ULC3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB23Q9ULC3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB23Q9ULC3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB23Q9ULC3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB23Q9ULC3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB23Q9ULC3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB23Q9ULC3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB23Q9ULC3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB23Q9ULC3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB23Q9ULC3 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB23Q9ULC3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB23Q9ULC3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB23Q9ULC3 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB23Q9ULC3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB23Q9ULC3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB23Q9ULC3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB23Q9ULC3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB23Q9ULC3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB23Q9ULC3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB23Q9ULC3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB23Q9ULC3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB23Q9ULC3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB23Q9ULC3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB23Q9ULC3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RAB23Q9ULC3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
RAB23Q9ULC3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RAB23Q9ULC3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RAB23Q9ULC3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RAB23Q9ULC3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RAB23Q9ULC3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RAB23Q9ULC3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB23Q9ULC3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB23Q9ULC3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB23Q9ULC3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB23Q9ULC3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB23Q9ULC3 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB23Q9ULC3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB23Q9ULC3 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB23Q9ULC3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB23Q9ULC3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB23Q9ULC3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB23Q9ULC3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB23Q9ULC3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB23Q9ULC3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB23Q9ULC3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB23Q9ULC3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB23Q9ULC3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB23Q9ULC3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB23Q9ULC3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB23Q9ULC3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB23Q9ULC3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB23Q9ULC3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB23Q9ULC3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB23Q9ULC3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB23Q9ULC3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB23Q9ULC3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB23Q9ULC3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB23Q9ULC3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB23Q9ULC3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB23Q9ULC3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB23Q9ULC3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB23Q9ULC3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB23Q9ULC3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB23Q9ULC3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB23Q9ULC3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB23Q9ULC3 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB23Q9ULC3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB23Q9ULC3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB23Q9ULC3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB23Q9ULC3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB23Q9ULC3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB23Q9ULC3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB23Q9ULC3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB23Q9ULC3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB23Q9ULC3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB23Q9ULC3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB23Q9ULC3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB23Q9ULC3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB23Q9ULC3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB23Q9ULC3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB23Q9ULC3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB23Q9ULC3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB23Q9ULC3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB23Q9ULC3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB23Q9ULC3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB23Q9ULC3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB23Q9ULC3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB23Q9ULC3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB23Q9ULC3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB23Q9ULC3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB23Q9ULC3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB23Q9ULC3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB23Q9ULC3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB23Q9ULC3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB23Q9ULC3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB23Q9ULC3 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB23Q9ULC3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB23Q9ULC3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms