Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms