Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP3Q9UKI2 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms