Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ98

STAG3, Cohesin subunit SA-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3Q9UJ98 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms