Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TFIP11Q9UBB9 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TFIP11Q9UBB9 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TFIP11Q9UBB9 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TFIP11Q9UBB9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TFIP11Q9UBB9 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TFIP11Q9UBB9 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TFIP11Q9UBB9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TFIP11Q9UBB9 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TFIP11Q9UBB9 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TFIP11Q9UBB9 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TFIP11Q9UBB9 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TFIP11Q9UBB9 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TFIP11Q9UBB9 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TFIP11Q9UBB9 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TFIP11Q9UBB9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TFIP11Q9UBB9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TFIP11Q9UBB9 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TFIP11Q9UBB9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TFIP11Q9UBB9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TFIP11Q9UBB9 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TFIP11Q9UBB9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TFIP11Q9UBB9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TFIP11Q9UBB9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TFIP11Q9UBB9 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TFIP11Q9UBB9 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TFIP11Q9UBB9 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TFIP11Q9UBB9 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TFIP11Q9UBB9 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TFIP11Q9UBB9 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TFIP11Q9UBB9 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TFIP11Q9UBB9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TFIP11Q9UBB9 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TFIP11Q9UBB9 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TFIP11Q9UBB9 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TFIP11Q9UBB9 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TFIP11Q9UBB9 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TFIP11Q9UBB9 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TFIP11Q9UBB9 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TFIP11Q9UBB9 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TFIP11Q9UBB9 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TFIP11Q9UBB9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TFIP11Q9UBB9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TFIP11Q9UBB9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TFIP11Q9UBB9 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms