Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms