Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CHPF2Q9P2E5 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHPF2Q9P2E5 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms