Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HCN3Q9P1Z3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms