Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EHD3Q9NZN3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms