Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZJ4

SACS, Sacsin, humanhuman

Predictions only

Length 4,579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SACSQ9NZJ4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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SACSQ9NZJ4 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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SACSQ9NZJ4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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SACSQ9NZJ4 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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SACSQ9NZJ4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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SACSQ9NZJ4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SACSQ9NZJ4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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