Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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GDE1Q9NZC3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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GDE1Q9NZC3 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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GDE1Q9NZC3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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