Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CDK12Q9NYV4 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms