Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMOD3Q9NYL9 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
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