Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZDHHC3Q9NYG2 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZDHHC3Q9NYG2 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZDHHC3Q9NYG2 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ZDHHC3Q9NYG2 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZDHHC3Q9NYG2 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZDHHC3Q9NYG2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZDHHC3Q9NYG2 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZDHHC3Q9NYG2 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZDHHC3Q9NYG2 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZDHHC3Q9NYG2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZDHHC3Q9NYG2 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ZDHHC3Q9NYG2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZDHHC3Q9NYG2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZDHHC3Q9NYG2 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZDHHC3Q9NYG2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZDHHC3Q9NYG2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZDHHC3Q9NYG2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZDHHC3Q9NYG2 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZDHHC3Q9NYG2 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZDHHC3Q9NYG2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZDHHC3Q9NYG2 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ZDHHC3Q9NYG2 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZDHHC3Q9NYG2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZDHHC3Q9NYG2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZDHHC3Q9NYG2 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZDHHC3Q9NYG2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZDHHC3Q9NYG2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZDHHC3Q9NYG2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZDHHC3Q9NYG2 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZDHHC3Q9NYG2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZDHHC3Q9NYG2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZDHHC3Q9NYG2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ZDHHC3Q9NYG2 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ZDHHC3Q9NYG2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZDHHC3Q9NYG2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZDHHC3Q9NYG2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZDHHC3Q9NYG2 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZDHHC3Q9NYG2 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZDHHC3Q9NYG2 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZDHHC3Q9NYG2 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZDHHC3Q9NYG2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZDHHC3Q9NYG2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZDHHC3Q9NYG2 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ZDHHC3Q9NYG2 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZDHHC3Q9NYG2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZDHHC3Q9NYG2 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZDHHC3Q9NYG2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZDHHC3Q9NYG2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZDHHC3Q9NYG2 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZDHHC3Q9NYG2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZDHHC3Q9NYG2 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZDHHC3Q9NYG2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZDHHC3Q9NYG2 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZDHHC3Q9NYG2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZDHHC3Q9NYG2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZDHHC3Q9NYG2 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZDHHC3Q9NYG2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZDHHC3Q9NYG2 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZDHHC3Q9NYG2 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZDHHC3Q9NYG2 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZDHHC3Q9NYG2 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ZDHHC3Q9NYG2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZDHHC3Q9NYG2 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZDHHC3Q9NYG2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZDHHC3Q9NYG2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZDHHC3Q9NYG2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZDHHC3Q9NYG2 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZDHHC3Q9NYG2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZDHHC3Q9NYG2 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZDHHC3Q9NYG2 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZDHHC3Q9NYG2 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms