Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXC10Q9NYD6 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
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