Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYB5

SLCO1C1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1C1Q9NYB5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms