Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
FANCLQ9NW38 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCLQ9NW38 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms