Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO28Q9NVF7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO28Q9NVF7 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms