Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUK0

MBNL3, Muscleblind-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBNL3Q9NUK0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MBNL3Q9NUK0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MBNL3Q9NUK0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MBNL3Q9NUK0 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MBNL3Q9NUK0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MBNL3Q9NUK0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MBNL3Q9NUK0 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MBNL3Q9NUK0 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MBNL3Q9NUK0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBNL3Q9NUK0 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBNL3Q9NUK0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBNL3Q9NUK0 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBNL3Q9NUK0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBNL3Q9NUK0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBNL3Q9NUK0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBNL3Q9NUK0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBNL3Q9NUK0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBNL3Q9NUK0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBNL3Q9NUK0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBNL3Q9NUK0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBNL3Q9NUK0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBNL3Q9NUK0 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBNL3Q9NUK0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MBNL3Q9NUK0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBNL3Q9NUK0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBNL3Q9NUK0 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBNL3Q9NUK0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBNL3Q9NUK0 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBNL3Q9NUK0 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBNL3Q9NUK0 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBNL3Q9NUK0 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBNL3Q9NUK0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBNL3Q9NUK0 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBNL3Q9NUK0 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBNL3Q9NUK0 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBNL3Q9NUK0 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBNL3Q9NUK0 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBNL3Q9NUK0 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBNL3Q9NUK0 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBNL3Q9NUK0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBNL3Q9NUK0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MBNL3Q9NUK0 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms