Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PNPLA3Q9NST1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PNPLA3Q9NST1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PNPLA3Q9NST1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PNPLA3Q9NST1 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PNPLA3Q9NST1 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PNPLA3Q9NST1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PNPLA3Q9NST1 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PNPLA3Q9NST1 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PNPLA3Q9NST1 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PNPLA3Q9NST1 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PNPLA3Q9NST1 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PNPLA3Q9NST1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PNPLA3Q9NST1 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PNPLA3Q9NST1 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PNPLA3Q9NST1 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PNPLA3Q9NST1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PNPLA3Q9NST1 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PNPLA3Q9NST1 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PNPLA3Q9NST1 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PNPLA3Q9NST1 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PNPLA3Q9NST1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PNPLA3Q9NST1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms