Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX3

NDUFA4L2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 4-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA4L2Q9NRX3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFA4L2Q9NRX3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms