Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNNM1Q9NRU3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNNM1Q9NRU3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNNM1Q9NRU3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNNM1Q9NRU3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNNM1Q9NRU3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNNM1Q9NRU3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CNNM1Q9NRU3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNNM1Q9NRU3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNNM1Q9NRU3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CNNM1Q9NRU3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CNNM1Q9NRU3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNNM1Q9NRU3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNNM1Q9NRU3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CNNM1Q9NRU3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNNM1Q9NRU3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNNM1Q9NRU3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNNM1Q9NRU3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNNM1Q9NRU3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNNM1Q9NRU3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNNM1Q9NRU3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNNM1Q9NRU3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNNM1Q9NRU3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNNM1Q9NRU3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNNM1Q9NRU3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNNM1Q9NRU3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNNM1Q9NRU3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNNM1Q9NRU3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNNM1Q9NRU3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNNM1Q9NRU3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNNM1Q9NRU3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNNM1Q9NRU3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNNM1Q9NRU3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNNM1Q9NRU3 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNNM1Q9NRU3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNNM1Q9NRU3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CNNM1Q9NRU3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CNNM1Q9NRU3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNNM1Q9NRU3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNNM1Q9NRU3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNNM1Q9NRU3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNNM1Q9NRU3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNNM1Q9NRU3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNNM1Q9NRU3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNNM1Q9NRU3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNNM1Q9NRU3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNNM1Q9NRU3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNNM1Q9NRU3 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CNNM1Q9NRU3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNNM1Q9NRU3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNNM1Q9NRU3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNNM1Q9NRU3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNNM1Q9NRU3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNNM1Q9NRU3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNNM1Q9NRU3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNNM1Q9NRU3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNNM1Q9NRU3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNNM1Q9NRU3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CNNM1Q9NRU3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNNM1Q9NRU3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNNM1Q9NRU3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNNM1Q9NRU3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNNM1Q9NRU3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNNM1Q9NRU3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNNM1Q9NRU3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNNM1Q9NRU3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNNM1Q9NRU3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNNM1Q9NRU3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNNM1Q9NRU3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNNM1Q9NRU3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNNM1Q9NRU3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms