Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FZD3Q9NPG1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms