Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9D4

ZNF408, Zinc finger protein 408, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF408Q9H9D4 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF408Q9H9D4 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF408Q9H9D4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms