Protein–RNA interactions for Protein: Q9H816

DCLRE1B, 5' exonuclease Apollo, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1BQ9H816 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DCLRE1BQ9H816 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DCLRE1BQ9H816 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DCLRE1BQ9H816 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DCLRE1BQ9H816 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DCLRE1BQ9H816 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DCLRE1BQ9H816 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DCLRE1BQ9H816 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DCLRE1BQ9H816 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCLRE1BQ9H816 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCLRE1BQ9H816 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCLRE1BQ9H816 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCLRE1BQ9H816 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCLRE1BQ9H816 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCLRE1BQ9H816 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCLRE1BQ9H816 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCLRE1BQ9H816 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
DCLRE1BQ9H816 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCLRE1BQ9H816 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCLRE1BQ9H816 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCLRE1BQ9H816 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCLRE1BQ9H816 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCLRE1BQ9H816 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
DCLRE1BQ9H816 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCLRE1BQ9H816 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCLRE1BQ9H816 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCLRE1BQ9H816 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCLRE1BQ9H816 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCLRE1BQ9H816 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCLRE1BQ9H816 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCLRE1BQ9H816 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCLRE1BQ9H816 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCLRE1BQ9H816 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCLRE1BQ9H816 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms