Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6T3

RPAP3, RNA polymerase II-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP3Q9H6T3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms