Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EHD4Q9H223 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EHD4Q9H223 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms