Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SHARPINQ9H0F6 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms