Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms