Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms