Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TM6SF1Q9BZW5 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms