Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP9-4Q9BYQ2 SERPINB3-202ENST00000332821 1541 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP9-4Q9BYQ2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP9-4Q9BYQ2 MTRNR2L4-201ENST00000399974 1762 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP9-4Q9BYQ2 FER-209ENST00000618353 1420 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP9-4Q9BYQ2 SPO11-202ENST00000371260 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
KRTAP9-4Q9BYQ2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-4Q9BYQ2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-4Q9BYQ2 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-4Q9BYQ2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-4Q9BYQ2 IL24-204ENST00000391929 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-4Q9BYQ2 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-4Q9BYQ2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-4Q9BYQ2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-4Q9BYQ2 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-4Q9BYQ2 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-4Q9BYQ2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-4Q9BYQ2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-4Q9BYQ2 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR7E91P-201ENST00000400027 866 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-4Q9BYQ2 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL035401.1-201ENST00000420572 871 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-4Q9BYQ2 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL121983.2-201ENST00000426899 688 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-4Q9BYQ2 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-4Q9BYQ2 SCP2-207ENST00000435345 894 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-4Q9BYQ2 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC092669.1-202ENST00000449673 905 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-4Q9BYQ2 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-4Q9BYQ2 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-4Q9BYQ2 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-4Q9BYQ2 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-4Q9BYQ2 HOPX-209ENST00000508121 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-4Q9BYQ2 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC017007.5-201ENST00000511590 874 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC034205.1-201ENST00000520621 638 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC108471.2-205ENST00000529314 628 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-4Q9BYQ2 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-4Q9BYQ2 LACRT-203ENST00000547511 504 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-4Q9BYQ2 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-4Q9BYQ2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP001496.2-202ENST00000579933 977 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF559-203ENST00000585352 967 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR663AHG-218ENST00000598448 804 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNF219-AS1-213ENST00000607860 577 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-4Q9BYQ2 Z93930.3-201ENST00000607919 749 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-4Q9BYQ2 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR7E91P-202ENST00000642062 1198 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-4Q9BYQ2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-4Q9BYQ2 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-4Q9BYQ2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-4Q9BYQ2 PCAT1-202ENST00000561978 1992 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
KRTAP9-4Q9BYQ2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-4Q9BYQ2 AK3-201ENST00000359883 1536 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-4Q9BYQ2 BRD7P4-201ENST00000406170 1522 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL592494.2-201ENST00000425455 1548 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-4Q9BYQ2 RBM4-202ENST00000396053 1337 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-4Q9BYQ2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-4Q9BYQ2 HAND2-204ENST00000621866 1337 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-4Q9BYQ2 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-4Q9BYQ2 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-4Q9BYQ2 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-4Q9BYQ2 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-4Q9BYQ2 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-4Q9BYQ2 C3orf49-201ENST00000295896 1292 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR2Y1-201ENST00000307832 1058 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-4Q9BYQ2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-4Q9BYQ2 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-4Q9BYQ2 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-4Q9BYQ2 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-4Q9BYQ2 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-4Q9BYQ2 DCUN1D2-AS-201ENST00000414992 330 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-4Q9BYQ2 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-4Q9BYQ2 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-4Q9BYQ2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms