Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RNF17Q9BXT8 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms