Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB11FIP5Q9BXF6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RAB11FIP5Q9BXF6 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RAB11FIP5Q9BXF6 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RAB11FIP5Q9BXF6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RAB11FIP5Q9BXF6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB11FIP5Q9BXF6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB11FIP5Q9BXF6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB11FIP5Q9BXF6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB11FIP5Q9BXF6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB11FIP5Q9BXF6 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB11FIP5Q9BXF6 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB11FIP5Q9BXF6 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB11FIP5Q9BXF6 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB11FIP5Q9BXF6 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB11FIP5Q9BXF6 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB11FIP5Q9BXF6 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB11FIP5Q9BXF6 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB11FIP5Q9BXF6 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms