Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRIP1Q9BX63 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BRIP1Q9BX63 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms