Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SYCP2Q9BX26 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms